검색으로 돌아가기
기록
基于SpyCatcher-CBM3-Tn5-His的鉴定转录因子结合DNA序列的方法
발명유효
1조회수
7청구항 · 1 독립항
§ Ⅰ
개요
발명자
洪泂; 章可辉; 王冬梅
IPC 분류
C12Q 1/6869 (2018.01)G01N 33/68 (2006.01)
本发明公开了基于SpyCatcher‑CBM3‑Tn5‑His的鉴定转录因子结合DNA序列的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)构建SpyCatcher‑CBM3‑Tn5‑His融合蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:9所示;(2)构建KmRgt1‑2×SpyTag表达菌株,其中,KmRgt1‑2×SpyTag核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;(3)将SpyCatcher‑CBM3‑Tn5‑His融合蛋白与包含马赛克序列的接头序列孵育得到SCT全酶;(4)将SCT全酶固定在无定形纤维素RAC上,和含有KmRgt1‑2×SpyTag的细胞裂解液孵育;(5)Tn5切割蛋白结合的DNA片段后构建测序文库。该方法无需依赖抗原抗体反应,规避了甲醛交联对表位的影响,适用于真菌、植物等有细胞壁的生物,具有高分辨率、低背景、低成本的特点,可应用于转录因子调控网络研究。