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기록

基于NGS技术对SMA相关基因拷贝数的检测方法及试剂盒

발명유효
8청구항 · 2 독립항
§ Ⅰ

개요

발명자

刘博; 孙翠莲; 周桂兰

IPC 분류

C12Q 1/6883 (2018.01)C12Q 1/6869 (2018.01)C12N 15/11 (2006.01)

本发明涉及基于NGS技术对SMA相关基因拷贝数的检测方法及试剂盒,检测方法包括以下步骤:提取待测样本DNA并构建NGS文库;基于SMN1/SMN2差异位点a、b、c设计特异性捕获探针,全外显子测序获得原始测序数据;对测序原始数据进行数据预处理;选择人类对照基因集合作为管家基因候选集,从管家基因候选集中筛选与SMN1和SMN2全外显子测序深度接近的n个基因作为管家基因k;标准化每个管家基因k的测序深度,归一化得到值;所有管家基因平均值记为校正因子,校正待测DNA样品中SMN1和SMN2基因拷贝状态。其有益效果是,SMN1与SMN2基因拷贝数定量的准确性,同时提高了检测效率。