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기록
基于群体样本eQTL和单细胞eQTL的数据分析方法及系统
발명유효
1조회수
10청구항 · 2 독립항
§ Ⅰ
개요
발명자
陈放; 王颖黎
IPC 분류
G16B 20/20 (2019.01)G16B 40/00 (2019.01)
本申请涉及生物信息学和基因组学领域,公开了一种基于群体样本eQTL和单细胞eQTL的数据分析方法及系统。该方法通过构建群体样本与单细胞eQTL效应值之间的线性关系,利用非负最小二乘法估计各细胞类型的权重系数,并基于权重系数将群体样本eQTL信息整合到单细胞eQTL中,生成改进的单细胞eQTL效应估计值,然后将其应用于全基因组关联分析与eQTL位点的共定位分析,从而获得具有显著统计关联的细胞特异性基因调控位点。本发明能够有效提高单细胞eQTL分析的统计效能,同时保持对细胞类型特异性调控信号的捕捉,为进一步研究基因表达调控机制提供新的思路和方法。