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기록
一种基于二代测序数据的突变背噪过滤算法
발명유효
9청구항 · 1 독립항
§ Ⅰ
개요
발명자
韩天澄; 黄宇; 刘丹; 范锐; 谭云涛; 范新平; 陈进祥; 骆磊; 陈维之; 杜波
IPC 분류
G16B 20/50 (2019.01)G16B 20/30 (2019.01)G16B 40/20 (2019.01)G16B 50/10 (2019.01)G06F 18/241 (2023.01)
本发明公开了一种基于二代测序数据的突变背噪过滤算法,涉及高通量测序数据分析技术领域,以解决现有技术依赖基线、适配性差、假阳性高的问题。该算法先预处理测序数据获pileup文件,按序列上下文分类位点并计算错误率,构建分层背噪模型检验突变,结合样本类型定性真实突变与背噪,同时评估样本质量。其无需预先构建基线,适配杂交捕获与扩增子测序,能提升突变检测特异性与重复样本一致性,保障结果可靠,适用于肿瘤基因检测等场景。