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本发明适用于模块化系统集成技术领域，提供了一种主配微模块互联互通的系统，包括主控制模块、至少一个功能微模块以及互联互通网络；主控制模块通过互联互通网络与所有功能微模块双向通信连接；本发明通过三重递进技术点实现：物理层采用自适应接口矩阵实现主配模块间的无差别硬件互联；协议层采用动态权重协商机制实现异构模块的协议兼容与数据交互；应用层采用分布式资源调度算法实现全局负载均衡与协同工作；解决了现有模块化系统中接口不兼容、协议异构性强、资源调度效率低的技术问题，能够实现多数功能微模块与主控制模块的即插即用，显著提升系统的可扩展性、可靠性与运行效率，适用于工业控制、智能家居、数据中心等多个领域。