一种组织切片上空间细菌物种检测的方法

本发明公开了一种组织切片上空间细菌物种检测的方法。该方法通过在载玻片上的组织切片表面安装具有正交微通道阵列的微流控装置，分别加载空间标签X和Y多核苷酸，在组织平面形成二维空间坐标体系，实现细菌核酸信号的空间编码。经逆转录、模板转换、PCR扩增及高通量测序，可获得细菌物种的序列信息及空间定位数据。该方法以细菌16S rRNA序列为检测靶标，结合链霉亲和素磁珠富集与生物素标记体系，能够实现多种细菌物种的并行检测。与传统FISH及阵列捕获方法相比，本发明具有检测通量高、分辨率约50微米、成本低及操作流程简化等优点，适用于宿主组织中细菌群落空间结构的研究及微生物生态分布分析。