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一种使用高光谱鉴定马铃薯抗旱基因的方法
InventionActive
7Claims · 1 independent
§ Ⅰ
Dossier Overview
Inventor
王晓娇; 逯春杏; 曹春梅; 胡嘉鑫; 许飞; 闻利威; 韩艺
IPC Classification
G16B 35/00 (2019.01)G16B 40/00 (2019.01)G06V 20/10 (2022.01)G06V 10/774 (2022.01)G06V 10/776 (2022.01)G06V 10/766 (2022.01)G06N 20/20 (2019.01)
本发明提供一种使用高光谱鉴定马铃薯抗旱基因的方法,涉及农作物抗旱基因鉴定技术领域,包括:设置干旱组和对照组,同步获取植株冠层高光谱图像与转录组数据并建立关联数据集;提取光谱特征,筛选干旱响应候选基因;基于斯皮尔曼相关分析计算各候选基因与光谱特征的相关系数,根据其绝对值排序后的若干位均值是否超过阈值确定初选基因集;以光谱特征为输入、初选基因表达量为输出构建随机森林回归模型,通过验证样本预测表达量,依据决定系数和预测误差筛选目标抗旱基因;构建目标基因过表达植株,测定干旱下生理指标相对变化率及基因表达量变化倍数,计算综合功能验证指数,若超过阈值则判定为具抗旱功能的基因。
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