基于深度嵌入与基因网络约束的关键致病因子筛选方法

本发明属于生物特征识别技术领域，涉及一种基于深度嵌入与基因网络约束的关键致病因子筛选方法，该方法先获取基因表达矩阵；构建与基因表达矩阵对应的基因互作网络，生成稀疏邻接矩阵、稀疏掩码矩阵；构建基因网络约束的图变分自编码器模型，模型的输入为基因表达矩阵，编码器采用稀疏掩码矩阵M以元素级乘法的形式限制权重连接，解码器根据潜在结构特征重构输入基因表达矩阵，输出端的多任务预测模块通过并行的分类分支和回归分支预测感染阶段概率分布、病原负荷；对构建的模型进行训练；根据模型的任务输出对输入基因进行特征归因分析，计算各基因的重要性得分，生成关键基因候选集，该方法显著提升了筛选结果的生物学合理性与稳定性。