一种多倍体基因组表观数据拆分分析方法

本发明提供一种多倍体基因组表观数据拆分分析方法，步骤如下：S1、获取原始数据，接头去除并过滤低质量序列；S2、使用bowtie2软件以‑k’n’为参数单端比对参考基因组，将对比结果进行筛选；S3、记录双端匹配的Reads及匹配染色体编号；S4、将参考基因组拆分为多套，且每套基因组单独构建参考基因组索引；S5、按照步骤S3得到的记录提取序列，按染色体编号分配到对应的亚基因组；S6、按照双端比对流程将每组序列比对对应亚基因组，最后识别每套基因组peaks信息，即完成多倍体基因组表观数据拆分分析。本发明通过优化比对参数，增加后续序列辨认筛选策略，准确区分同源染色体间的表观数据，实现了遗传结构的准确区分。