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기록

基于隐式神经网络的空间转录组超分辨率重构方法及系统

발명유효
10청구항 · 2 독립항
§ Ⅰ

개요

발명자

吕晖; 李浩男; 孔艳; 钟炳旭; 任永永

IPC 분류

G16B 40/00 (2019.01)G16B 25/00 (2019.01)G06N 3/04 (2023.01)G06F 18/23 (2023.01)G06F 18/15 (2023.01)

本发明涉及一种基于隐式神经网络的空间转录组超分辨率重构方法及系统,其中方法包括以下步骤:获取空间转录组数据;计算质量控制指标,过滤低质量数据;进行基因表达计数的预处理,并识别高变基因;以归一化后的某一空间坐标作为隐式神经网络的输入,将隐式神经网络输出层神经元的数量定义为高变基因数量,以基因表达预测向量作为输出,通过最小化基因表达预测向量与经过预处理后的高变基因的基因表达值之间的误差对隐式神经网络进行训练;生成高分辨率坐标网格;将高分辨率坐标网格中的每一坐标点输入隐式神经网络,生成高分辨率基因表达矩阵,并通过标准化的逆运算转换回原始数据尺度。与现有技术相比,本发明具有高预测精度和连续空间预测能力。