一种基于基因调控网络特征的猪SNP芯片构建方法及应用

本申请公开了一种基于基因调控网络特征的猪SNP芯片构建方法，涉及动物遗传育种技术领域，包括：构建与目标性状和组织类型相关的猪组织特异性多层级基因调控网络；基于所述基因调控网络对全基因组SNP进行功能注释与网络综合特征提取；对提取的网络综合特征进行得分排序与筛选，筛选具有调控功能潜力的SNP变异位点，构建猪SNP位点的集合，制备SNP芯片。通过引入组织/性状相关的基因调控网络信息，对全基因组范围内的SNP位点进行功能优先级排序和筛选，从而显著提升芯片中SNP的性状解释能力和育种值估计准确性。