在测序运行期间修改测序循环或成像以满足定制的覆盖度估计

本公开描述了可以修改测序运行以确保所有基因组样本满足目标读段覆盖度水平的方法、非暂态计算机可读介质和系统。所公开的系统可以基于(i)属于从索引序列得到的每个样本的簇和/或(ii)与流通池池内的每个样本相对应的过滤器度量来估计基因组池中的每个基因组样本的读段覆盖度。所公开的系统可以基于所估计的读段覆盖度和目标读段覆盖度来修改测序运行。例如，所公开的系统可以调整测序运行内的测序循环的数量，以确保所有基因组样本都满足目标读段覆盖度。附加地或另选地，所公开的系统可以确定要成像的流通池小区的集合，以确保所有基因组样本都满足目标读段覆盖度。