基于图神经网络的药物-靶标结合亲和力预测方法

本发明提供了基于图神经网络的药物‑靶标结合亲和力预测方法，包括：(1)获取药物的SMILES序列和靶标蛋白质的氨基酸序列；(2)将所述药物的SMILES序列转换为药物分子图，通过图卷积神经网络对所述药物分子图进行特征提取，得到药物特征向量；(3)将所述靶标蛋白质的氨基酸序列输入Transformer编码器进行特征提取，得到蛋白质特征向量；(4)将所述药物特征向量与蛋白质特征向量进行融合，得到融合特征向量；(5)将所述融合特征向量输入多层感知机，输出药物‑靶标结合亲和力预测结果。本发明结合GCN和Transformer的混合模型用于DTA预测。