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Dossier

一种基于大数据分析的杀鲑气单胞菌毒力预测方法

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8Claims · 1 independent
§ Ⅰ

Dossier Overview

Inventor

肖鹏; 谭训刚; 刘鹰; 王丽雯; 肖坤; 李贵阳

IPC Classification

G16B 40/00 (2019.01)G16B 40/20 (2019.01)G16B 30/10 (2019.01)G06F 18/10 (2023.01)G06F 18/214 (2023.01)G06F 18/213 (2023.01)G06F 18/27 (2023.01)G06F 18/24 (2023.01)G06F 16/28 (2019.01)G06F 16/25 (2019.01)

本发明公开了一种基于大数据分析的杀鲑气单胞菌毒力预测方法,该方法包括:通过从多个渠道搜集、整理并构建杀鲑气单胞菌数据库;对杀鲑气单胞菌数据进行清洗、基因组组装与注释,形成完整的注释数据集;通过生物信息学分析,构建杀鲑气单胞菌比较基因组学框架,提炼毒力相关特征;运用逻辑回归算法建立模型,设定阈值判定毒力等级;使用逻辑回归模型预测杀鲑气单胞菌毒力,进行ROC分析评估模型性能;将待预测的基因组与其他信息输入至模型中,输出其毒力等级预测结果;对预测结果的置信水平进行评估,向用户提供关于预测不确定性的量化信息。本发明方法能够提高预测的准确性和可靠性,还为病原菌的防控和治疗提供了新的思路。

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