一种基于双通路稀疏注意力的抗菌肽预测方法

本发明公开了一种基于双通路稀疏注意力的抗菌肽预测方法。该方法具体步骤如下：使用蛋白质语言模型提取初始嵌入；利用通道注意力增强的卷积神经网络自适应地对通道进行加权；使用基于滑动窗口的局部稀疏注意力来捕获氨基酸残基之间的短程相互作用；使用包含评分函数的全局稀疏注意力来获取关键氨基酸残基与序列的长程相互作用，将局部和全局信息进行整合以此实现对肽序列的完整表征；对最终的特征矩阵使用全连接层进行预测。本发明使用简洁高效的训练过程对肽的序列信息进行全面建模，引入双通路稀疏注意力机制来有效缓解表征冗余和计算复杂度的问题。